Cell | 免疫营养不良中免疫细胞特异基因调控动态全景图

东京大学的研究课题其他部门和RIKEN Research研究课题所的同事们现在确立了首个针对自身免疫更进一步营养不良和自身慢性病营养不良的性状原始元数据。期望这一资源能为免疫系统营养不良的发展提供更进一步见解，并有可能有助于药物的辨认出。生物学家们还期望，与免疫系统无关的真核生物原始数据图解最终有可能应用于诸如COVID-19等疟疾的研究课题。

东京大学项目研究课题主管，临床风湿病学家，功用真核生物学专家Mineto Ota博士话说：“要明了营养不良，就必需深刻理解性状性状突变的功用。有了这个原始数据集，我们就可以将与营养不良无关的DNA多肽变化的原始数据与对营养不良发病机制极为极其重要的性状和细胞会各种类型保持联系大大的。”Ota是该团队发表在《Cell》杂志上的社论的主要写作者，社论书名为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该项目是与Chugai Pharmaceutical的生物学家们合作来进行的。

写作者所写，免疫系统激活的营养不良（IMD）之外从自身免疫更进一步到自身黏膜的多种病症。他们宣称，尽管IMD里炎性细胞会因子的反常社会活动表明免疫系统细胞会功用愈演愈烈了变化，但是，“对于IMD的无关性状甚至无关细胞会各种类型知之甚少。”

以外真核生物关联性研究课题（GWAS）辨认出了许多与IMD无关的真核生物位点。但是，在此类关联性研究课题里鉴定出的许多性状性状突变都坐落调节性状“on”或“off”表达的DNA非UTF-周围，而不是坐落性状UTF-多肽里。研究课题小组宣称：“GWAS现在推断出了许多与精细个体和营养不良无关的真核生物位点，之外IMD。这些性状突变里的大多数都坐落非UTF-真核生物周围，尤其是催化反应元件，如增强子和残基。”

为了推断出催化反应DNA的功用，一种完全相同各种类型的真核生物量化，称作表达定量个体性状位点（eQTL），力图将DNA多肽的区别与表观的区别保持联系大大的。利用eQTL原始数据，研究课题其他部门可以对催化反应DNA多肽的目的、催化反应多肽里的性状突变如何严重影响其催化反应性状的表达以及这些表观区别如何致使营养不良做更明智的推测。

其它针对免疫系统的eQTL研究课题现在在来进行里，但先前的研究课题工作只之外保健志愿者，并检查了有限量的细胞会各种类型。研究课题其他部门所写：“对保健NADPH免疫系统细胞会的研究课题有可能很难捕获营养不良精神状态下辨认出的一系列eQTL现象。此外，虽然对免疫系统细胞会的实验性刺激可以在某种程度上实时营养不良精神状态，但并不却是反映出体外的心理环境。”

Ota缺少道：“黏膜精神状态下，免疫系统细胞会的天体物理学特性与保健精神状态下的相同细胞会截然完全相同。与免疫系统现况无关的性状性状突变有可能只在患病精神状态下起起着，因此对于这种各种类型的性状研究课题，从真正病患者身上利用采样极为极其重要。”

在他们除此以外报导的研究课题里，研究课题小组对79名保健志愿者和337名被诊断患上10种完全相同各种类型免疫系统激活营养不良（之外类风湿性关节炎、更进一步红斑狼疮和更进一步乳腺癌）的病患者来进行了以外真核生物测序。所有志愿者都是日本人血统。

明了免疫系统激活的营养不良有着说服力，因为尽管每种营养不良在临床上都是完全相同的，但仍有许多交叠之处，并且有着相同诊断的病患者有可能会表现出极为完全相同的症状。研究课题其他部门缺少话说：“由于所有这些多样性，一次学习一种免疫系统激活营养不良的能力是有限的。但是，如果我们一起研究课题10种营养不良，就可以更以外面地明了这些各种类型的营养不良。”

在启动以外真核生物测序后，研究课题其他部门从志愿者的血清采样里分离出28种完全相同各种类型的免疫系统无关细胞会，并测算了这些细胞会里的表观。“我们在图解里看到，每种免疫系统细胞会各种类型都有完全相同的eQTL结果，这可以去找我们细胞会各种类型彼此间性状催化反应的区别，以及哪种细胞会各种类型对于发展哪种营养不良至关极其重要。”研究课题其他部门话说。

写作者报告话说，“在表观量化里，我们在一个SDK上对多个IMD来进行比较，使我们只能描述每个营养不良（病患者）的特征，并识别与单个营养不良特异性无关的性状，以及在一组IMD里功能障碍的移动式……我们的原始数据集使我们只能监测每个特定细胞会各种类型里eQTL现象的心理（营养不良）取材驱动的干扰。”

研究课题其他部门将得到的资源名字为东京大学免疫系统细胞会表观图解（ImmuNexUT），并话说它代表了适用东亚国家血统志愿者确立的小得多的eQTL原始数据集。他们总结道：“我们确定了免疫系统细胞会各种类型特异性的eQTL现象，之外直到现在未报导的罕见细胞会各种类型，它们在心理黏膜必要条件下的多样性，以及这些eQTL与IMD性状彼此间的相当大关联性。”

“到目前为止，在这一领域，大规模的真核生物和功用真核生物研究课题主要是利用北美ACS来进行的，尽管社会性多样性对于精确理解真核生物功用至关极其重要。”研究课题其他部门话说，“这个日本人病人的eQTL图解对于克服这种以北美为里心的偏见，转化北美的原始数据集进一步研究课题DNA性状突变的功用，也有着极其重要内涵。”

研究课题其他部门期望ImmuNexUT原始元数据将继续增长，并最终为病患者带给更佳的结果。他们话说：“与在此之后报导的资源相较，我们的原始数据集有着独特而有利的优点，之外以外面的免疫系统细胞会分为、ACS彼此间免疫系统现况的变化以及同质的非北美ACS。”